據悉，T2設置了120臺自助值機、52臺自助行李托運設備，旅客可通過自助設備辦理選擇座位、打印登機牌、行李托運手續（僅限常規尺寸行李）等服務。自助值機設備分布在各值機區，旅客如果攜帶了需托運的行李，可前往值機區H、L，使用自助行李托運設備辦理托運手續；如果行李超重的話，國內航班旅客可在H區的設備上通過微信、支付寶等方式實現逾重行李費自助付費（僅限南航實際承運航班）。
而乘坐南航國內出港航班無行李托運的旅客，在線上值機后可在手機上生成二維碼電子登機牌，即可憑二維碼直接前往安檢。與之前不同的是，旅客在安檢后手機上的二維碼電子登機牌會被加注“安檢驗訖章”，隨后憑帶有安檢驗訖章的電子登機牌即可登機，不需要紙質登機牌或是在安檢打印紙質憑證。登機口支持為有需要的旅客打印登機憑條。
除智能化乘機服務外，南航還將提供網上查詢航班動態、預訂餐食、改簽、獲取航延證明、開具機票電子發票等服務。
截至目前，南航已在廣州、北京、深圳、上海等26個國內機場及2個境外機場開通了電子登機牌服務，后續將進一步加大推廣力度，使電子登機牌服務覆蓋更多的境內外機場，同時在更多機場啟用電子“安檢驗訖章”。
如果需要到人工柜臺辦理乘機手續，南航國內航班旅客可到E區、F區、G區辦理，國際（地區）航班旅客可到P區辦理。南航頭等艙、公務艙旅客及南航金銀卡或天合優享會員，乘坐國內航班可到C區、D區相應柜臺辦理，乘坐國際（地區）航班可到Q區相應柜臺辦理。
南航代理的大韓航空、越南航空、法國航空、俄羅斯航空、中華航空等天合聯盟航空公司，以及泰國國際航空、新加坡航空、日本航空公司也將于5月19日轉場至廣州白云機場T2運行。乘坐上述航空公司航班的旅客，在M、N區辦理乘機手續。
